Informazioni sul ruolo
Informazioni su Turing
Turing è una delle principali aziende al mondo nel campo dell'infrastruttura per l'AGI e collabora con i laboratori di IA di frontiera per accelerare lo sviluppo dei modelli attraverso dati di addestramento di alta qualità, valutazioni e talenti ingegneristici.
Panoramica del ruolo:
Cerchiamo esperti di progettazione computazionale di proteine con esperienza, che esplorino e valutino approcci avanzati di IA generativa per l'ingegneria proteica nell'ambito di un'iniziativa di valutazione scientifica dell'IA di frontiera.
In questo ruolo svilupperà task di valutazione scientifica impegnativi relativi alla generazione de novo di proteine, alla progettazione di strutture basata sulla diffusione, allo sviluppo di binder proteici e all'ottimizzazione sequenza–struttura. Condurrà in autonomia esperimenti computazionali, valuterà i progetti proteici generati dall'IA e svilupperà benchmark riproducibili e risultati tecnici di proof-of-concept per valutare le capacità e i limiti dei modelli di IA generativa nell'ingegneria proteica.
Di cosa si occuperà:
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Progettare task di valutazione scientificamente rigorosi relativi alla progettazione de novo di proteine, alla generazione di binder condizionata dal bersaglio, al motif scaffolding e all'ottimizzazione sequenza–struttura.
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Sviluppare ed eseguire flussi di lavoro di progettazione computazionale di proteine utilizzando modelli di IA generativa, approcci basati sulla diffusione e strumenti consolidati di ingegneria proteica.
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Definire gli input dei task, i vincoli biologici, gli output attesi, i criteri di valutazione e i protocolli sperimentali riproducibili.
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Valutare le sequenze e le strutture proteiche generate dall'IA in termini di confidenza del ripiegamento, previsioni di stabilità strutturale, validità geometrica, qualità dell'interfaccia, novità e plausibilità biologica.
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Analizzare il ripiegamento delle proteine, le relazioni sequenza–struttura e le interazioni proteina–proteina per valutare la qualità e la fattibilità dei progetti generati.
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Sviluppare rubriche di punteggio oggettive, analisi di riferimento e metodi di validazione computazionale per valutare le prestazioni dei modelli.
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Individuare i limiti dei modelli, i casi di fallimento, le previsioni strutturali irrealistiche e le potenziali debolezze nei progetti proteici generati.
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Distinguere le previsioni computazionali dai risultati validati sperimentalmente e documentare le ipotesi scientifiche e i limiti.
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Preparare benchmark di valutazione riproducibili, report di analisi computazionale e documentazione tecnica.
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Sintetizzare i risultati in report tecnici concisi e contribuire a dimostrazioni di proof-of-concept per iniziative di valutazione scientifica dell'IA.
Cosa cerchiamo:
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Dottorato (in corso o conseguito) in Biologia computazionale, Biologia strutturale, Bioinformatica, Biochimica, Ingegneria proteica o in una disciplina strettamente affine.
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Esperienza pratica in almeno un'area principale: progettazione computazionale di proteine, predizione della struttura proteica, modellizzazione molecolare o ingegneria proteica.
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Solida comprensione del ripiegamento delle proteine, delle relazioni struttura–funzione delle proteine, delle interazioni molecolari e dell'ottimizzazione sequenza–struttura.
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Familiarità pratica con strumenti di progettazione computazionale di proteine e di analisi strutturale come RFdiffusion, ProteinMPNN, AlphaFold, Rosetta, PyMOL o ChimeraX.
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Solide competenze di programmazione in Python, con esperienza nello sviluppo o nell'esecuzione di flussi di lavoro di biologia computazionale.
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Esperienza con i formati di dati di sequenze e strutture proteiche come FASTA, PDB e mmCIF.
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Capacità di valutare strutture proteiche, interpretare le previsioni computazionali e verificare la validità scientifica dei progetti generati.
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Solide capacità analitiche e di problem solving, con la capacità di progettare esperimenti in autonomia, valutare i risultati e individuare i limiti tecnici.
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Eccellenti capacità di comunicazione scritta per documentare i risultati scientifici, le metodologie di valutazione e i report tecnici.
Requisiti graditi:
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Esperienza con modelli di IA generativa o di progettazione di proteine basati sulla diffusione, in particolare RFdiffusion o approcci analoghi.
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Esperienza pratica nella progettazione de novo di proteine, nella progettazione di binder proteici, nel motif scaffolding o nell'ingegneria enzimatica.
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Esperienza nell'ottimizzazione di sequenze proteiche, nel raffinamento strutturale, nel docking proteina–proteina o nella valutazione computazionale dell'affinità.
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Familiarità con lo screening computazionale, il benchmarking della progettazione di proteine e le pipeline di valutazione automatizzata.
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Esperienza nello sviluppo di task di valutazione scientifica, rubriche di punteggio, soluzioni di riferimento o benchmark computazionali riproducibili.
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Esperienza nella valutazione di strutture biologiche generate dall'IA, di modelli di base scientifici (foundation model) o di sistemi generativi di progettazione di proteine.
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Esperienza di ricerca in ingegneria proteica computazionale, simulazioni molecolari o bioinformatica strutturale.
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Pubblicazioni, contributi di ricerca o esperienza di sviluppo open source nella biologia computazionale o nella progettazione di proteine.
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Esperienza pregressa nell'addestramento dell'IA, nella valutazione di modelli scientifici, nello sviluppo di proof-of-concept tecnici o in collaborazioni di ricerca.
Deliverable previsti:
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Una raccolta curata di task riproducibili di valutazione della progettazione computazionale di proteine, con input chiaramente definiti, output attesi e rubriche di punteggio oggettive.
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Analisi computazionale dei progetti proteici generati dall'IA, che documenti la qualità strutturale, la plausibilità biologica, i limiti dei modelli e i casi di fallimento.
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Un report tecnico conciso che riassuma i risultati della valutazione, supportato da una dimostrazione di proof-of-concept per una potenziale partnership di valutazione scientifica dell'IA.
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Dettagli dell'offerta:
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Impegno richiesto: almeno 4 ore al giorno e 40 ore a settimana, con 4 ore di sovrapposizione con il fuso orario PST.
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Tipo di rapporto: incarico come contractor (senza copertura sanitaria né congedi retribuiti)
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Durata del contratto: 1 mese; [la data di inizio prevista è la prossima settimana]
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Sede: India, Pakistan, Nigeria, Kenya, Egitto, Ghana, Bangladesh, Turchia, Messico