关于此职位
关于 Turing
Turing 是全球领先的 AGI 基础设施公司之一，与前沿 AI 实验室合作，通过高质量的训练数据、评估和工程人才加速模型开发。
职位概述：
我们正在寻找经验丰富的计算蛋白质设计专家，作为前沿 AI 科学评估计划的一部分，探索并评估用于蛋白质工程的先进生成式 AI 方法。
在该职位中，您将开发具有挑战性的科学评估任务，涉及从头蛋白质生成、基于扩散的结构设计、蛋白质结合剂开发以及序列-结构优化。您将独立开展计算实验，评估 AI 生成的蛋白质设计，并开发可复现的基准和技术概念验证成果，以评估生成式 AI 模型在蛋白质工程中的能力与局限。
您将做什么：
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设计科学严谨的评估任务，涉及从头蛋白质设计、靶点条件化结合剂生成、基序支架设计以及序列-结构优化。
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使用生成式 AI 模型、基于扩散的方法和成熟的蛋白质工程工具，开发并执行计算蛋白质设计工作流程。
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定义任务输入、生物学约束、预期输出、评估标准和可复现的实验方案。
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评估 AI 生成的蛋白质序列和结构，包括折叠置信度、结构稳定性预测、几何有效性、界面质量、新颖性和生物学合理性。
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分析蛋白质折叠、序列-结构关系以及蛋白质-蛋白质相互作用，以评估所生成设计的质量和可行性。
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开发客观的评分标准、参考分析和计算验证方法，以评估模型性能。
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识别模型的局限性、失败案例、不切实际的结构预测，以及所生成蛋白质设计中的潜在弱点。
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区分计算预测与经实验验证的结果，并记录科学假设和局限性。
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准备可复现的评估基准、计算分析报告和技术文档。
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将研究发现总结为简明的技术报告，并为科学 AI 评估计划的概念验证演示做出贡献。
我们期待的人选：
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计算生物学、结构生物学、生物信息学、生物化学、蛋白质工程或密切相关学科的博士学位（在读或已完成）。
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至少在一个主要领域拥有实践经验：计算蛋白质设计、蛋白质结构预测、分子建模或蛋白质工程。
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深入理解蛋白质折叠、蛋白质结构-功能关系、分子相互作用以及序列-结构优化。
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实际熟悉计算蛋白质设计和结构分析工具，例如 RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold、Rosetta、PyMOL 或 ChimeraX。
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具备扎实的 Python 编程能力，并有开发或执行计算生物学工作流程的经验。
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有处理蛋白质序列和结构数据格式（如 FASTA、PDB 和 mmCIF）的经验。
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能够评估蛋白质结构，解读计算预测结果，并评估所生成设计的科学有效性。
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具备出色的分析和解决问题的能力，能够独立设计实验、评估结果并识别技术局限。
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具备出色的书面沟通能力，能够记录科学发现、评估方法和技术报告。
加分项：
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有生成式 AI 或基于扩散的蛋白质设计模型的经验，尤其是 RFdiffusion 或类似方法。
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在从头蛋白质设计、蛋白质结合剂设计、基序支架设计或酶工程方面拥有实践经验。
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有蛋白质序列优化、结构精修、蛋白质-蛋白质对接或计算亲和力评估的经验。
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熟悉计算筛选、蛋白质设计基准测试和自动化评估流水线。
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有开发科学评估任务、评分标准、参考解答或可复现的计算基准的经验。
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有评估 AI 生成的生物结构、科学基础模型或生成式蛋白质设计系统的经验。
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具有涉及计算蛋白质工程、分子模拟或结构生物信息学的研究经验。
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在计算生物学或蛋白质设计领域有发表论文、研究贡献或开源开发经验。
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有 AI 训练、科学模型评估、技术概念验证开发或研究合作方面的经验。
预期交付成果：
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一套精心整理的、可复现的计算蛋白质设计评估任务，包括明确定义的输入、预期输出和客观的评分标准。
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对 AI 生成的蛋白质设计进行计算分析，记录结构质量、生物学合理性、模型局限性和失败案例。
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一份总结评估发现的简明技术报告，并附有针对潜在科学 AI 评估合作的概念验证演示作为支撑。
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录用详情：
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投入要求：每天至少 4 小时，每周 40 小时，与 PST 有 4 小时的重叠时间。
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用工类型：合同工任务（不含医疗/带薪假期）
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合同期限：1 个月；[预计下周开始]
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地点：印度、巴基斯坦、尼日利亚、肯尼亚、埃及、加纳、孟加拉国、土耳其、墨西哥